Każdy gracz kiedy osiągnie rangę gennin, otrzymuje jedną bądź dwie specjalizacje do wyboru, specjalizacji nie można zmienić od tak, zostaje ona aż do śmierci postaci. Każda specjalizacja niesie za sobą premię, dzięki czemu stajemy się silniejsi opanowując jedną ze specjalności. A oto i specjalizacje:

Każda osoba bez klanu może posiadać DWIE specjalizacje, natomiast gdy się go posiada ogranicza się do JEDNEJ

NinJutsu
Szybsza nauka wszystkich NinJutsu poza żywiołowymi o 10%.
Zwiększony pokład chakry o 125 punktów.
Jedno dowolne Ninjutsu poza żywiołowymi kosztuję o 20% mniej chakry.

TaiJutsu
Szybsza nauka TaiJutsu o 25%
Zwiększona Kondycja o 75 punktów.
Zwiększona Szybkość o 25 punktów.
Jedno dowolne TaiJutsu kosztuję o 20% mniej kondycji.

GenJutsu
Szybsza nauka GenJutsu o 25%.
Zwiększona Inteligencja o 100 punktów.
Jedno dowolne GenJutsu kosztuję o 20% mniej chakry.

FuuinJutsu
Szybsza nauka FuuinJutsu o 25%.
Zwiększony pokład chakry o 150 punktów.

Katon
Szybsza nauka wszystkich jutsu natury Katon o 25%.
Zwiększony pokład chakry o 75 punktów.
Zwiększona Kondycja o 25 punktów.
Jedno dowolne NinJutsu natury Katon kosztuję o 20% mniej chakry.

Fuuton
Szybsza nauka wszystkich jutsu natury Fuuton o 25%.
Zwiększony pokład chakry o 75 punktów.
Zwiększona Szybkość o 25 punktów.
Jedno dowolne NinJutsu natury Fuuton kosztuję o 20% mniej chakry.

Doton
Szybsza nauka wszystkich jutsu natury Doton o 25%.
Zwiększony pokłąd chakry o 75 punktów.
Zwiększona wytrzymałość o 25 punktów.
Jedno dowolne NinJutsu natury Doton kosztuję o 20% mniej chakry.

Raiton
Szybsza nauka wszystkich jutsu natury Raiton o 25%
Zwiększony pokład chakry o 50 punktów.
Zwiększona szybkość o 25 punktów.
Zwiększona kondycja o 25 punktów.
Jedno dowolne NinJutsu natury Raiton kosztuję o 20% mniej chakry.

Suiton
Szybsza nauka wszystkich jutsu natury Suiton o 25%.
Zwiększony pokład chakry o 100 punktów.
Jedno dowolne NinJutsu natury Suiton kosztuję o 20% mniej chakry.

Gate
Szybsza nauka wszystkich bram życia o 25%
Pozwala posiadać 210 chakry maksymalnie zamiast 200.
Zwiększona szybkość o 50 punktów.